Thompson, que intenta convertirse en el primer ganador consecutivo del Deere desde que Steve Stricker lograra tres entre 2009 y 2011, firmó una tarjeta de 67 golpes, cuatro bajo par, para situarse con 15 bajo par y un total de 198 después de 54 hoyos en el ventoso TPC Deere Run en Silvis, Illinois.
"Me sentí bien. Estuve pegando donde quería la mayor parte del día", dijo Thompson. "Fue complicado. El viento lo hizo difícil.
"Estaba bastante contento con cómo iban las cosas. No estaba anotando bien en los primeros nueve hoyos, pero luego pude terminar fuerte. Estuvo bien".
El estadounidense de 26 años embocó un putt para birdie de dos metros en el hoyo 14 para compartir el liderato, y luego lo mantuvo con un putt para birdie dado en el par cinco del 17 después de fallar un putt para eagle de dos metros y medio.
En el 18, Thompson dejó su approach a poco más de tres metros del hoyo y embocó el putt decisivo para ponerse líder en solitario.
"Ha sido bonito conseguirlo y ponerme líder en solitario", dijo Thompson. "Hacer birdie al 17 y al 18 siempre es genial".
Compartiendo el segundo puesto con 199 estaban sus compatriotas Max Homa, Brian Campbell y David Lipsky, además del argentino Emiliano Grillo, todos ellos con 68 golpes.
"Hacía mucho viento ahí fuera", dijo Homa. "Estaba muy contento con mi mentalidad. Hice todo lo que quería. Podría haberme puesto un poco ansioso y no lo hice, y esa fue la clave de la ronda."
Thompson, que busca su segundo título de la PGA, ocupa el puesto 70 en la lista de puntos de la temporada del circuito, la última plaza para clasificarse para los playoffs del mes que viene.
"Espero hacer una buena ronda mañana", dijo Thompson. "Sólo ser paciente y ceñirme a mi plan de juego".
El número 99 del mundo, Homa, seis veces ganador del PGA Tour con sólo un top-25 esta temporada, embocó un putt de birdie de dos metros y medio en el 17 para unirse al grupo de segundos.
Grillo embocó un putt de 15 pies para birdie en el par tres del hoyo 16 y otro en el 18 desde poco menos de un metro y medio para compartir el segundo puesto.
Campbell cerró con birdies consecutivos, el último desde 11 metros, para compartir el segundo puesto, mientras que el putt para birdie de Lipsky desde poco más de un metro en el 17 le dejó a uno de la cabeza.
Hubo hasta 10 jugadores compartiendo el liderato en un momento de la competición.
Kevin Roy, un estadounidense de 35 años que busca su primer título de la PGA en su 50ª participación en el circuito,abrió con cuatro birdies para hacerse con el liderato inicial, pero cerró con cuatro bogeys en los últimos ocho hoyos para firmar 70 golpes y situarse a cuatro de la cabeza.