Álex Márquez, piloto de Ducati-Gresini, firmó el mejor tiempo de la clasificación con un minuto, 56 segundos y 493 milésimas, apenas 0.070" más rápido que Marc.
El español Pedro Acosta partirá tercero, por delante del japonés Ai Ogura y del italiano Marco Bezzecchi.
El piloto de Ducati dispone ahora de una gran oportunidad para ampliar su ventaja de 10 puntos sobre Martín en el campeonato, tras asegurarse un puesto en la primera fila tanto para la carrera esprint del sábado como para la cita dominical.
Martín llegó a Malasia con una fractura en la muñeca sufrida durante la carrera esprint del Gran Premio de Australia y superó sin problemas la primera sesión de entrenamientos del viernes en Sepang, pero finalmente ha tenido que renunciar.
Tras la cita de Malasia, restarán tres fines de semana de competición para definir el campeonato.